一、生產工藝區別
1、磷酸二氫銨又稱磷酸一銨（簡稱MAP），分子式為NH4H2PO4，易溶于水，水溶液呈酸性。一般采用一次氨中和，中和度控制在1.00左右，造粒一般有噴漿造粒干燥和噴霧干燥兩種，現最多的是噴霧干燥法生產粉狀一銨，作為復合肥生產的原料。
2、磷酸氫二銨又稱磷酸二銨（簡稱DAP），分子式為(NH4)2HPO4，易溶于水，不溶于乙醇。一般是在一次氨中和基礎上再采用二次氨中和，使其料漿中和度提高至1.70左右，成品中和度達到1.50左右，造粒采用噴漿造粒工藝，一般只生產粒狀產品。
二、性能及應用的區別
1、磷酸二氫銨的密度較磷酸氫二銨大，所以對包裝、儲存和運輸均較為有利。
2、磷酸二氫銨的穩定性和臨界相對濕度較磷酸氫二銨高。
3、磷酸二氫銨的氨蒸氣壓很低，故在生產和使用過程中氨損失較磷酸氫二銨小。
4、磷酸氫二銨與過磷酸鈣混合時因生成磷酸二鈣而結塊，并使五氧化二磷水溶性降低。磷酸二氫銨與過磷酸鈣混合，則退化程度較小。
5、磷酸二氫銨的五氧化二磷質量分數可達52%，對缺磷富氮地區較為適用。
6、作為復混肥或摻混肥的磷素原料，磷酸二氫銨較磷酸氫二銨適應范廣。
7、磷酸二氫銨在土壤中溶解后PH在4.4左右，有利于作物吸收利用磷。磷酸氫二銨在土壤中溶解后PH在8.0左右，如果是堿性土壤，就可能釋放出氨，使種子和幼苗受到傷害，因此堿性土壤慎用磷酸氫二銨。磷酸二氫銨與尿索混合，能減少氨揮發損失，提高肥料利用率。
8、磷酸氫二銨含氮量高，對生產廠家來說，因其利用其氮含量而獲利，目前廣泛應用于摻混肥。對于農民來說根據土攘性質選擇磷酸二氫銨是必要的。
9、磷酸二氫銨是一種水溶性速效復合肥，有效磷（AP2O5）與總氮（TN）含量的比例約5.44:1，是高濃度磷復肥的主要品種之一。該產品一般作追肥，也是生產三元復混肥、BB肥最主要的基礎原料；廣泛適用于水稻、小麥、玉米、高梁、棉花、瓜果、蔬菜等各種糧食作物和經濟作物；還適用于紅壤、黃壤、棕壤、黃潮土、黑土、褐土、紫色土、白漿土等各種土質；尤其適合于我國西北、華北、東北等干旱少雨地區施用。
10、磷酸氫二銨是一種高濃度的速效肥料，適用于各種作物和土壤，特別適用于喜銨需磷的作物，作基肥或追肥均可，宜深施。